在靈神星軌道器的發射確定延期一個半月後，同在該次發射擔任副酬載的雙胞胎太空船—Janus任務也受到嚴重影響，由於發射日期的修改，使得原本八月初發射且前往目標小行星的軌跡變得不可行，不再可能用現有的太空船設計來執行預定的地球飛掠，這些飛掠對於導向目標的兩顆小行星，也就是1991 VH和1996 FG3的飛掠探勘來說至關重要。
不過，如果任務能在10月7日至10日之間發射，Janus太空船有可能到達最初的雙小行星目標之一：1996 FG3。但那將接近靈神星任務新發射窗口的後段，該窗口將於10月11日關閉，在那個窗口下，任務將把兩艘太空船都送到1996 FG3小行星，讓它們倆實現其閾值科學目標。
任務小組現在正在尋找替代的目標小行星，如果兩艘太空船不能飛過它的任何一個原始目的地，它們就可以改訪問這些替代的小行星。而任務團隊也已經發現了太空船可以訪問的多個小行星，具體取決於任務發射的日期。不過他們並沒有透露哪些正在考慮中，但表示有些違反了目前的任務限制，例如飛掠相對速度或通訊數據速率。任務團隊有說這些限制中的許多項都能適應，只是需要多做一點準備工作。而如果兩艘太空船都錯過了第二次的發射窗口，那發射時間就將回到最初的規劃，2023年發射升空。
任務團隊也被問到Janus太空船是否有脫離靈神星軌道器，轉換共乘火箭或是自行獨立發射的機會？初步評估下發現沒有其他合適的任務可以容納兩艘Janus太空船作為副酬載，並且可以更好地滿足任務的科學目標，這不會讓任務更接近最初的兩顆目標小行星，目前也沒有願意協助兩艘太空船獨立發射的機會。
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